Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms