Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms