Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms