Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM247A6NEH6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms