Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYVE1Q9Y5Y7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms