Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SNX13Q9Y5W8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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