Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GIT1Q9Y2X7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms