Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms