Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms