Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FZD1Q9UP38 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FZD1Q9UP38 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms