Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
COPS3Q9UNS2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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