Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VANGL2Q9ULK5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms