Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MED23Q9ULK4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED23Q9ULK4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms