Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRTO4Q9UKD2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms