Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms