Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms