Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX4Q9UBX2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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