Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH4Q9P003 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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