Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL28Q9NXS3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms