Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHBDL2Q9NX52 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms