Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPRSS4Q9NRS4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms