Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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