Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.3 ms