Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LHX9Q9NQ69 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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LHX9Q9NQ69 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LHX9Q9NQ69 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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