Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPHS2Q9NP85 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPHS2Q9NP85 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms