Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms