Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLMPQ9H6B4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms