Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL4Q9C0H6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL4Q9C0H6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.3 ms