Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms