Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF17Q9BXT8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms