Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD1Q9BXT4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDRD1Q9BXT4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms