Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms