Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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