Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CHCHD7Q9BUK0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CHCHD7Q9BUK0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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