Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2AFJQ9BTM1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms