Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms