Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms