Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5Q99717 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5Q99717 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms