Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms