Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAM1Q96QH2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAM1Q96QH2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms