Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM47Q96LD4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms