Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms