Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STAMBPL1Q96FJ0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STAMBPL1Q96FJ0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms