Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms