Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHFRQ96EP1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms