Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms