Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DPF3Q92784 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms