Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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