Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms