Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L2Q8NAA4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms